Skip to main content

Table 5 The MolDock scores and AutoDock Vina binding affinity of the docked compounds

From: Virtual screening, pharmacokinetics, and molecular dynamics simulations studies to identify potent approved drugs for Chlamydia trachomatis treatment

Positions Ligand MolDock score Rerank score HBond AutoDock vina: ligand Binding affinity
1 6e7e-23 − 105.42 − 83.3015 − 2.3003 6e7e_36 − 6.9
2 6e7e-51 − 104.935 − 86.2557 − 0.4690 6e7e_37 − 6.9
3 6e7e-32 − 103.832 − 81.4928 − 5.9129 6e7e_39 − 6.9
4 6e7e-16 − 102.325 − 81.2418 − 9.2016 6e7e_44 − 6.8
5 6e7e-44 − 101.187 − 81.2352 − 2.8332 6e7e_50 − 6.8
6 6e7e-0 − 101.058 − 78.2991 − 1.1185 6e7e_11 − 6.7
7 6e7e-35 − 100.81 − 74.1065 − 2.7562 6e7e_20 − 6.7
8 6e7e-48 − 100.468 − 83.5565 − 4.8169 6e7e_38 − 6.6
9 6e7e-27 − 99.6987 − 47.8776 − 5.9033 6e7e_4 − 6.5
10 6e7e-15 − 99.0472 − 59.3321 − 7.1583 6e7e_13 − 6.5
11 6e7e-41 − 97.9657 − 83.8199 − 8.4460 6e7e_17 − 6.5
12 6e7e-34 − 97.7763 − 75.7789 − 2.5000 6e7e_29 − 6.5
13 6e7e-31 − 97.7655 − 71.8349 − 4.6374 6e7e_30 − 6.5
14 6e7e-29 − 97.5903 − 80.7864 − 1.3863 6e7e_32 − 6.5
15 6e7e-25 − 97.1211 − 76.7611 − 4.3095 6e7e_33 − 6.5
16 6e7e-5 − 97.0019 − 78.9432 − 2.5118 6e7e_43 − 6.5
17 6e7e-43 − 96.9476 − 65.1119 − 2.1904 6e7e_6 − 6.4
18 6e7e-55 − 96.5008 − 80.0093 − 4.9261 6e7e_16 − 6.4
19 6e7e-42 − 96.1401 − 61.68 − 2.5000 6e7e_21 − 6.4
20 6e7e-30 − 96.0124 − 79.8537 − 1.9294 6e7e_26 − 6.4
21 6e7e-37 − 96.0051 − 79.1085 − 8.6238 6e7e_42 − 6.4
22 6e7e-50 − 95.9272 − 80.5706 − 5.0000 6e7e_51 − 6.4
23 6e7e-39 − 95.494 − 73.5631 − 10.064 6e7e_1 − 6.3
24 6e7e-47 − 94.6542 − 44.1998 − 5.6681 6e7e_18 − 6.3
25 6e7e-46 − 93.8322 − 62.9706 − 8.4617 6e7e_2 − 6.2
26 6e7e-26 − 93.7623 − 80.0366 − 1.4509 6e7e_5 − 6.2
27 6e7e-11 − 93.429 − 59.9426 − 5.2496 6e7e_10 − 6.2
28 6e7e-3 − 92.5362 − 77.3104 − 1.9807 6e7e_23 − 6.2
29 6e7e-36 − 92.5281 − 50.0261 − 1.8100 6e7e_25 − 6.2
30 6e7e-7 − 92.0915 − 73.6281 − 1.6712 6e7e_49 − 6.2
31 6e7e-14 − 91.8754 − 59.7878 − 5.9914 6e7e_3 − 6.1
32 6e7e-24 − 91.383 − 75.9929 − 1.7595 6e7e_7 − 6.1
33 6e7e-13 − 90.7777 − 78.6832 − 1.1915 6e7e_22 − 6.1
34 6e7e-1 − 89.6732 − 73.1549 − 2.8683 6e7e_27 − 6.1
35 6e7e-21 − 88.9992 − 71.4621 − 3.0701 6e7e_34 − 6.1
36 6e7e-10 − 88.9228 − 76.5735 − 3.2483 6e7e_56 − 6.1
37 6e7e-28 − 88.1999 − 54.2836 − 2.0728 6e7e_14 − 6
38 6e7e-53 − 85.632 − 70.8852 − 3.0808 6e7e_40 − 6
39 6e7e-54 − 85.2067 − 70.4645 − 2.6669 6e7e_41 − 6
40 6e7e-12 − 84.9434 − 68.4636 − 2.2346 6e7e_48 − 6
41 6e7e-8 − 84.2814 − 72.91 − 5.1099 6e7e_54 − 6
42 6e7e-6 − 84.2788 − 76.5631 − 5.6531 6e7e_55 − 6
43 6e7e-9 − 83.9689 − 49.0408 − 3.0917 6e7e_57 − 6
44 6e7e-18 − 83.7369 − 67.9812 − 1.5962 6e7e_19 − 5.9
45 6e7e-22 − 83.2384 − 54.5351 − 8.8782 6e7e_28 − 5.9
46 6e7e-20 − 83.1924 − 73.3381 − 2.5000 6e7e_46 − 5.9
47 6e7e-40 − 83.1795 − 68.9391 − 10.526 6e7e_53 − 5.9
48 6e7e-45 − 83.109 − 59.1662 − 7.3442 6e7e_58 − 5.9
49 6e7e-19 − 82.4367 − 64.012 − 2.7144 6e7e_9 − 5.8
50 6e7e-4 − 80.9586 − 69.733 − 0.8362 6e7e_12 − 5.8
51 6e7e-38 − 80.7574 − 64.5247 − 9.0498 6e7e_15 − 5.8
52 6e7e-33 − 80.4312 − 69.4863 − 6.9611 6e7e_31 − 5.8
53 6e7e-52 − 79.6886 − 67.2744 − 3.2095 6e7e_47 − 5.8
54 6e7e-17 − 79.4327 − 67.8454 − 7.1736 6e7e_45 − 5.7
55 6e7e-49 − 79.0299 − 71.0073 − 3.8401 6e7e_8 − 5.4
56 6e7e-2 − 78.0893 − 70.0143 − 5.0968 6e7e_35 − 5.4
57 6e7e_52 − 5.3
58   6e7e_24 − 5.1