Virtual screening, pharmacokinetics, and molecular dynamics simulations studies to identify potent approved drugs for Chlamydia trachomatis treatment

Edache, Emmanuel Israel; Uzairu, Adamu; Shallangwa, Gideon Adamu; Mamza, Paul Andrew

doi:10.1186/s43094-021-00367-4

Future Journal of Pharmaceutical Sciences

Table 5 The MolDock scores and AutoDock Vina binding affinity of the docked compounds

From: Virtual screening, pharmacokinetics, and molecular dynamics simulations studies to identify potent approved drugs for Chlamydia trachomatis treatment

Positions	Ligand	MolDock score	Rerank score	HBond	AutoDock vina: ligand	Binding affinity
1	6e7e-23	− 105.42	− 83.3015	− 2.3003	6e7e_36	− 6.9
2	6e7e-51	− 104.935	− 86.2557	− 0.4690	6e7e_37	− 6.9
3	6e7e-32	− 103.832	− 81.4928	− 5.9129	6e7e_39	− 6.9
4	6e7e-16	− 102.325	− 81.2418	− 9.2016	6e7e_44	− 6.8
5	6e7e-44	− 101.187	− 81.2352	− 2.8332	6e7e_50	− 6.8
6	6e7e-0	− 101.058	− 78.2991	− 1.1185	6e7e_11	− 6.7
7	6e7e-35	− 100.81	− 74.1065	− 2.7562	6e7e_20	− 6.7
8	6e7e-48	− 100.468	− 83.5565	− 4.8169	6e7e_38	− 6.6
9	6e7e-27	− 99.6987	− 47.8776	− 5.9033	6e7e_4	− 6.5
10	6e7e-15	− 99.0472	− 59.3321	− 7.1583	6e7e_13	− 6.5
11	6e7e-41	− 97.9657	− 83.8199	− 8.4460	6e7e_17	− 6.5
12	6e7e-34	− 97.7763	− 75.7789	− 2.5000	6e7e_29	− 6.5
13	6e7e-31	− 97.7655	− 71.8349	− 4.6374	6e7e_30	− 6.5
14	6e7e-29	− 97.5903	− 80.7864	− 1.3863	6e7e_32	− 6.5
15	6e7e-25	− 97.1211	− 76.7611	− 4.3095	6e7e_33	− 6.5
16	6e7e-5	− 97.0019	− 78.9432	− 2.5118	6e7e_43	− 6.5
17	6e7e-43	− 96.9476	− 65.1119	− 2.1904	6e7e_6	− 6.4
18	6e7e-55	− 96.5008	− 80.0093	− 4.9261	6e7e_16	− 6.4
19	6e7e-42	− 96.1401	− 61.68	− 2.5000	6e7e_21	− 6.4
20	6e7e-30	− 96.0124	− 79.8537	− 1.9294	6e7e_26	− 6.4
21	6e7e-37	− 96.0051	− 79.1085	− 8.6238	6e7e_42	− 6.4
22	6e7e-50	− 95.9272	− 80.5706	− 5.0000	6e7e_51	− 6.4
23	6e7e-39	− 95.494	− 73.5631	− 10.064	6e7e_1	− 6.3
24	6e7e-47	− 94.6542	− 44.1998	− 5.6681	6e7e_18	− 6.3
25	6e7e-46	− 93.8322	− 62.9706	− 8.4617	6e7e_2	− 6.2
26	6e7e-26	− 93.7623	− 80.0366	− 1.4509	6e7e_5	− 6.2
27	6e7e-11	− 93.429	− 59.9426	− 5.2496	6e7e_10	− 6.2
28	6e7e-3	− 92.5362	− 77.3104	− 1.9807	6e7e_23	− 6.2
29	6e7e-36	− 92.5281	− 50.0261	− 1.8100	6e7e_25	− 6.2
30	6e7e-7	− 92.0915	− 73.6281	− 1.6712	6e7e_49	− 6.2
31	6e7e-14	− 91.8754	− 59.7878	− 5.9914	6e7e_3	− 6.1
32	6e7e-24	− 91.383	− 75.9929	− 1.7595	6e7e_7	− 6.1
33	6e7e-13	− 90.7777	− 78.6832	− 1.1915	6e7e_22	− 6.1
34	6e7e-1	− 89.6732	− 73.1549	− 2.8683	6e7e_27	− 6.1
35	6e7e-21	− 88.9992	− 71.4621	− 3.0701	6e7e_34	− 6.1
36	6e7e-10	− 88.9228	− 76.5735	− 3.2483	6e7e_56	− 6.1
37	6e7e-28	− 88.1999	− 54.2836	− 2.0728	6e7e_14	− 6
38	6e7e-53	− 85.632	− 70.8852	− 3.0808	6e7e_40	− 6
39	6e7e-54	− 85.2067	− 70.4645	− 2.6669	6e7e_41	− 6
40	6e7e-12	− 84.9434	− 68.4636	− 2.2346	6e7e_48	− 6
41	6e7e-8	− 84.2814	− 72.91	− 5.1099	6e7e_54	− 6
42	6e7e-6	− 84.2788	− 76.5631	− 5.6531	6e7e_55	− 6
43	6e7e-9	− 83.9689	− 49.0408	− 3.0917	6e7e_57	− 6
44	6e7e-18	− 83.7369	− 67.9812	− 1.5962	6e7e_19	− 5.9
45	6e7e-22	− 83.2384	− 54.5351	− 8.8782	6e7e_28	− 5.9
46	6e7e-20	− 83.1924	− 73.3381	− 2.5000	6e7e_46	− 5.9
47	6e7e-40	− 83.1795	− 68.9391	− 10.526	6e7e_53	− 5.9
48	6e7e-45	− 83.109	− 59.1662	− 7.3442	6e7e_58	− 5.9
49	6e7e-19	− 82.4367	− 64.012	− 2.7144	6e7e_9	− 5.8
50	6e7e-4	− 80.9586	− 69.733	− 0.8362	6e7e_12	− 5.8
51	6e7e-38	− 80.7574	− 64.5247	− 9.0498	6e7e_15	− 5.8
52	6e7e-33	− 80.4312	− 69.4863	− 6.9611	6e7e_31	− 5.8
53	6e7e-52	− 79.6886	− 67.2744	− 3.2095	6e7e_47	− 5.8
54	6e7e-17	− 79.4327	− 67.8454	− 7.1736	6e7e_45	− 5.7
55	6e7e-49	− 79.0299	− 71.0073	− 3.8401	6e7e_8	− 5.4
56	6e7e-2	− 78.0893	− 70.0143	− 5.0968	6e7e_35	− 5.4
57	–	–	–	–	6e7e_52	− 5.3
58	–	–		–	6e7e_24	− 5.1

Back to article page