Insilico design, ADMET screening, MM-GBSA binding free energy of novel 1,3,4 oxadiazoles linked Schiff bases as PARP-1 inhibitors targeting breast cancer

Future Journal of Pharmaceutical Sciences

Table 3 Binding free energy calculation using Prime/MM-GBSA approach of compounds (T1-T21)

Comp	ΔG bind (Kcal/ mol)	ΔG bind Coulomb	ΔG bind covalent	ΔG bind Vander	ΔG bind H Bond	ΔG bind Lipophilic
T1	− 43.97	− 5.28	1.75	− 31.2	− 0.2	− 22.82
T2	− 58.34	− 9.01	2.8	− 35.81	− 0.36	− 25.53
T3	− 54.8	− 0.21	1.96	− 40.82	0	− 26.21
T4	− 55.42	4	3.8	− 44.71	− 0.02	− 25
T5	− 60.29	7.07	2.45	− 45.31	− 0.93	− 15.34
T6	− 59.22	1.06	2.36	− 41.45	− 0.03	− 27.87
T7	− 65.31	− 2.54	2.82	− 44.32	− 0.12	− 29.21
T8	− 60.19	− 11.51	5.2	− 48.44	− 0.28	− 26.06
T9	− 51.63	1.08	0.86	− 38.85	0	− 25.07
T10	− 69.72	− 9.66	2.35	− 38.92	− 0.39	− 30.5
T11	− 48.36	− 7.72	5.26	− 34.34	− 0.34	− 23.76
T12	− 55.56	− 18.95	2.13	− 34.92	− 0.81	− 20.33
T13	− 63.76	− 16.4	6.17	− 43.65	− 0.62	− 23.41
T14	− 65.17	− 6.53	3.71	− 42.61	0	− 30.64
T15	− 47.29	− 5.33	2.73	− 33.65	− 0.16	− 27.19
T16	− 49.25	− 5.55	1.61	− 32.61	− 0.02	− 19.01
T17	− 73.9	− 7.23	0.92	− 40.09	0	− 35.43
T18	− 60.45	0.05	2.16	− 40.93	− 0.04	− 28.36
T19	− 49.74	− 2.56	5.46	− 40.19	− 0.13	− 25.94
T20	− 61.98	− 9.91	1.2	− 37.41	− 0.31	− 26.98
T21	− 64.32	− 20.33	3.66	− 38.8	− 0.84	− 20.33
Olaparib	− 121.53	− 39.94	3.54	− 61.19	− 1.23	− 37.94
Tamoxifen	− 65.62	− 11.83	7.01	− 44.73	− 0.25	− 41.83

Δ G bind, free energy of binding; ΔG bind Coulomb, Coulomb energy; ΔG bind covalent, covalent energy (internal energy); ΔG bind Vander, van der Waals energy; ΔG bind H Bond, hydrogen bonding energy; ΔG bind Lipophilic, hydrophobic energy (non-polar contribution estimated by solvent accessible surface area)